aids virus 보고서 [2005.12.29]

삼일전 자료를 정리하던중 발견한 메모 -- 삼년전에 작성된것

나의 기억속에서 사라지기 전에 리프레시하는 기분으로 ...........

참조한 책 ---------- stryer 박사의 책 , 그외 몇권의 책이 있었으나 기억안난다

삼년전의 메모를 다시 기억을 되살리느라 머리가 뽀개질것 같다

그리고 지금은 프로그램을 만드느라 정신이 없으므로 나중에 시간이 있으면 더자세히 쓰겠다

( 억지로 기억을 되살리면 지금만들고 있는 프로그램도 잊어버릴것 같아서 )

기억을 완전히 회복하지 못했으므로 틀린 부분이 많이 있을수 있으므로 양해바람

그리고 아래의 내용은 나의 사견임을 알려둔다 --- 시간이 지나면 많은 부분이 고쳐질수 있음

거의 대부분을 ( STRYER 제3판 ) 에서 정보를 얻었다 물론 이책도 거의 대부분을 인용한것이지만
이 인용 기술이 아주 탁월하다

IMAGE1 작성시기 : IMAGE2 보다 훨씬앞섰다
IMAGE2 작성시기 : IMAGE3 보다 앞섰다
IMAGE3 작성시기 : 2001년 에서 2002 사이에 작성된것으로 판단됨

--------- 본문 시작 ----------------------

스트리어 박사의 예리한 통찰력으로부터 많은 정보를 얻었다

image 1. 해설 -----

인간의 면역시스템이 어떻게 enemy cell 이나 기타 밝혀지지 않은 외부의 침입자에 대해서 항체를 생산하는가

외부의 침입물질에 대해서 제일먼저 반응하는 것이 helper t cell

helper t cell 외부의 침입물질(cell ,virus,기타유기 물질 )이 아군인가 적군인가를 조사한다

인간의 모든세포는 표면에 자기가 아군이라는 단백질을 달고 다닌다 (그리고 이단백질은 종류가 하나가 아니고 여러종류라고

추정됨 )

만약 helper t cell 이 아군단백질을 발견하지못하면 방어시스템이 가동하기 시작한다

적의 외부를 탐색하면서 항체를 생산하기 위한 준비작업에 들어간다

어떻게 외부의 표면에 꼮들어맞는 구조의 항체단백질을 만드는 구조는 아직도 밝혀지지 않았다

내가 제시한이론 )

helper t cell 의 MHC 시스템이 여러유전자의 단편을 조합해서 세포의 최대장점인 소량의 그러나 엄청나게

많은 종류의 스캔단백질을 표면에 위치시킨뒤 적의 단백질에 대해서 얼마나 많은 친화력을 가지고잇는 지

조사하게된다 만약 친화력이 없더라도 얼마나 가장친화력 없는지 조사할수도 있을것이다

만약 엄청나게 많은 종류의 스캔단백질 중에서 조금이라도 친화력이 있는것들은 적의 표면에 달러붙을것이다

그친화력의 정도에 따라 스캔단백질의 구조가 변하게 되고 그리고 그 강도가 일정 수준이상이되면

helper t cell의 세포질에서 센서단백질의 감도감응 신호 증폭작용이 일어나서 그스캔단백질을 기억한다

그리고 위의 반응을 되풀이하면서 좀더 강력한 친화력을 갖는 항체의 스캔단백질을 생산할수도있다

( 세포의 최대장점인 소량의 그러나 엄청많은 종류의 단백질을 생산하는것은 인간의 어떤 기계도 흉내내지 못한다 )

예를들어 100억개의 helper t cell 들의 MHC 시스템은 DNA 를 서로조합해서 세포한개당 한시간안에 1만개의
스캔단백질을 만든다면 모두 100조 = 100억 * 1만 개가 어떤 외계적을 스캔하면서 탐색하는 경우를 생각한다면
별무리가없을것이다
적어도 한개는 친화력이 있는 스캔단백질이 있을것이다

그다음단계 ------
helper t cell 스캔단백질을 기억하고난다음 enemy 로부터 분리된다

이제부터 helper t cell 은 스캔단백질의 구조를 갖는 항체를 대량 생산하기위하여 B CELL 에 도킹한다
( B CELL 항체를 대량 생산한다 )
helper t cell 은 스캔단백질의 구조를 B CELL 에 teaching (가르친다) 한다
(이때 CD4 단백질이 작용하는데 이단백질은 AIDS virus의 공격목표가 된다 )

이제 대량생산된 항체들 (imunglobunlin) 적들을 물리치는 여러 과정들은 아주잘 알려져 있으므로
생략한다 (실은 다 잊어먹었다 시간이 있을때 나중에 추가 )

//------ 면역시스템은 어떻게 AIDS virus 를 파괴하지 못하는가 -----------
AIDS virus 표면 전체는 면역 시스템의 CD4 단백질 에대해서 강력한 친화력을 가지고 있으므로
면역시스템이 AIDS virus 표면에 친화력을 갖는 항체 생산하면 이 항체들은 B CELL 파괴하므로
면역시스템이 면역시스템을 파괴 하게된다

그렇다면 AIDS virus 표면의 단백질의 노출되었는 표면말고 뒤쪽 깊숙한곳의 표면을 분석해서 항체를 만들어서
파괴 하면 가능할것이다 ( 그러나 이것은 인간의 면역시스템은 그러한 능력을 아직은 가지고있지 않다 )
인간의 면역시스템은 적의 표면을 분석해서 거개에 꼭들어맞는 항체를 생산하는 시스템이지
표면의 뒤쪽 깊숙한곳으로 삐집고 들어가서 후방을 공격하는 시스템을 갖고 있지않다 )

//------ 어떻게 AIDS virus 는 CD4 단백질 에대해서 강력한 친화력 가질수 있었을까 --------
포유류의 면역시스템은 CD4 처럼 적에게 절대로 노출되어서는 안될 단백질의 구조를 항상
helper t cell 표면에 달고 다니지 않을것이다 (꼭 필요한때에 번개처럼 나타났다가 순식간에 살아질수도 있다
이것이 바로 면역시스템의 우수한 성질일것이다 )
이이유로 CD4 teaching 하는 동안에만 존재할지도 모른다
만약 CD4가 항상존재한다면 이미 신석기나 구석기 이전부터 AIDS virus 나타났어야 했다

바이러스도 똑똑해서 생명체가 출몰한 수억년전부터 계속 생명체의 여러부분의 표면을 결합하면서 세포안으로
들어가는 방법을 이용했기 때문에 포유류의 면역체계는 이 바이러스의 전략을 피하기 위해 순간순가 그때마다
세포막에 CD4가 와같은 핵심적인 단백질의 구조체를 알리지 않으려고 진화했을것이다

virus 의 자기유전자 변형에 의한 공격은 정말로 경이적이지만 그렇다고 지능을 가지고 있지않기 때문에
아직 나타나지도 않을 CD4 를 공략의 대상으로 삼고 작전을 수행하지 않는다

일반적인 바이러스의 공략방법은 모든 세포의 표면에 공통적으로 가지고 있는 단백질을 대상으로(다른동물포함)
붙어서 세포안으로 들어간다

image 1. 인간의 면역 시스템

image 2. image 3. 해설 -----

---- 인공효소를 이용해서 AIDS virus 표면을 파괴해야한다

자연계에서 단백질의 표면을 파괴하는 단백질의 수가 엄청나게 많고 그리고 많은 수의 단백질의 구조가알려져있다

예를들어 인간의 눈물속에 포함되어있는 리소짐은 겨우 잔기가 100여개밖에 안되지만
어떤 보결원자단을 가지고 있지않아 속도는 느리지만 세균의 표면을 가수분해한다
만일 보조효소(vitamic c,b1,아니면 금속이온 Mg,Fe ion) 를 이용한 것들은 구조는 굉장히 복잡하지만 속도는 빠르다

이제 인공효소를 만든다면 우선 인공효소의 표면은 AIDS virus 표면의 GP120의 후방의 구조에 친화력을 갖는 구조의
잔기가 필요하다 만일 전방의 표면에 친화력을 갖는다면 이 인공효소는 면역세포들도 공격할것이다

이제는 이 인공효소에 다른단백질의 구조를 파괴하는 가장간단한 세린 가수분해 하는 잔기를 첨가해야한다
물론 보조효소를 쓰면 엄청나게 빠르게 AIDS virus 파괴 할수있지만 인공효소가 엄청나게 복잡해서
가뜩인 어려운 쏘프트웨어가 더복잡해지고 컴퓨터에게도 부하가 많이 결려 계산을 못할수도 있다
자연계안에서 세린 가수분해 하는 잔기를 갖는 효소가 엄청나게 많고 그부분의 잔기를 이인공효소에 첨가할수
있을것이다
그러나 같은 아미노 잔기를 이용한다 해도 다른 부분에 속한다면 구조가 아주현격히 달라진다
이것은 컴퓨터와 쏘프트웨어를 이용해서 보정해주어야 할것이다 (이것이 아주어려운 일이지만 )

마지막으로 이 인공효소에 면역 시스템에 의한 공격을 막기위해 인공효소에 자기가 적이 아니라는 구조의
id 의 잔기를 첨가해줄수 있다
이것도 우리 몸안에 밝혀진 구조의 아미노 잔기는 우리는 많이 알고있기 때문에 이것을 인공효소에
첨가한다 그리고 구조의 변형을 막기 위해
컴퓨터와 쏘프트웨어를 이용해서 보정해주어야 할것이다 (이것도 아주어려운 일이지만 )

------ 활동하는 AIDS virus 에 감염된 세포 표면을 파괴해야한다
위의 항체들이 해결할수 있을것이다
좀더 빠른파괴를 위해서는 인공항체를 만들어야하는데 이것은 위의것보다 훨씬복잡하다
이 인공항체를 만드는데는 컴퓨터가 핵심적인 역활을 할것이다

------ 활동하지 않는 AIDS virus 에 감염된 세포 표면을 파괴해야한다

세포의 핵을 분석하는 인공효소를 만들어야 하므로 위의것보다 더 엄청어렵다 , 사실상 불가능
그러나 혈액세포들은 그의 수명이 있다
예를 들어 적혈구는 수명이 180일이다
그러므로 인공효소를 이용해서 AIDS virus 를 철저히 파괴한다 면 활동하지 않는 AIDS virus 에 감염된 세포
는 그수가 감소하게되면 몇년안에 모두죽게 될것이다

세포 핵의 DNA의 서열을(최소한 5개이상 :일반적으로 DNA절단효소가 인식하는 서열수 ) 알아내기 위한 인공효소시스템은
적어도 열개이상의 인공효소가 필요하다

만일 세포질내에서의 인공효소들이 핵에 AIDS VIRUS의 특정한 염기서열을 탐지했다면
그다음에는 이세포가 AIDS VIRUS 에 감염됐다는사실을 외부에 알려주어서 이세포를 킬러세포에 의해서
사멸로 이끌어야한다
그렇다면 어떻게 알려줄수가 있을까
바로 세포막에 인공 면역그로블린에 결합할수있는 인공단백질표지를 심어주면 된다
여기에도 수십개의 인공단백질들이 필요할것이다
그다음에는 킬러세포에 의해서 잡아먹히거나 폭포작용에 의해서 세포막에 빵구가 나서 죽는일만 남는다

이 수십개의 인공효소들의 복잡한작용과 반응을 위한
이 아미노 잔기를 결정하는것은 아주빠른 속도의 컴퓨터와 그리고 아주 훌륭한 단백질접힘 구조를 해석할수있는
쏘프트웨어가 필요하지만 아직은 인류는 그런한 쏘프트웨어가 없다
그리고 당분간은 컴퓨터는 획득할수있어도 쏘프트웨어는 얻기가 힘들것이다

----- AIDS virus 가 잠복기가 길고 (어떤놈은 7년 ) 급성이아닌이유 ( 감염되자 마자 다음날 증세가 안나타나고
수년간에 걸쳐 인체를 병들게하고 낮게하고 종말에는 아예 입에 약을 달고다니게 만든다
걸어다니는 종합병원 인간이다 그러나 아무리 약을써도 낫지가 않는 엄청난 금전적 비용을 지불해야한다 )

:::: 이유 : 이것은 CD4가 순간적으로 존재했다가 사라지거나 아니면 그 수량이나 빈도수가 매우 희박하다는
것을 의미한다

image 2. aids virus 파괴 방법 (나의 생각 )

image 3. aids virus 파괴 방법 (나의 생각 )

------ 과연 AIDS virus 는 원숭이들로부터 왔는가 ------
이것이 정설로 되어있으나 다른가능성도 있다
virus 의 자기유전자 변형에 의한 공격은 정말로 경이적이지만 그렇다고 지능을 가지고 있지않기 때문에
아직 나타나지도 않을 CD4 를 공략의 대상으로 삼고 작전을 수행하지 않는다
왜 다른 동물에서도 AIDS virus 가없는가 (CD4는 동물에 따라 상당히 다르고 또거기에 맞는 AIDS virus 가
존재해야한다 어떤 동물은 상당히 지저분한 환경에서 존재하지만 그들은 없다 )
이유로
바로 생물병기로 개발되었을지도 모른다
어떤 생물병기는 만들기는 쉽지만 인간 면역시스템에 대한 방어가 불가능한다
냉전시대에 각국들은 앞다투어 생물병기를 개발했다

이것은 어디까지나 가정이지만
경비를 담당하는 공무원이나 군인이 퇴직후 자기연금이 부족하다는 이유에 불만을 품고 전에 창고에서
슬쩍한 생물병기를 퍼뜨렸는지도 모른다
위의 가능성은 영화 the 락인지 뭔지 하는 것에도 잘 나타나있다

그리고 앞으로도 그럴 가능성도 있다 ----

-------- 인공 효소 다른 이용방법 ------------------------
바이러스는 세포안으로 들어가 세포를 변형시켜 무한하게 증식하게 하고 죽이기도 한다
그리고 우리는 이러한 성질을 분석해서
인공효소를 만들어서 세포를 줄기세포로 변형시키도 하고
어떤 특정세포로 분화를 유도 하고 , 또 정지시킬수 있으것이다

난자에 전기충격을 가해서 분열을 조장하거나 , 조금복잡한 유기화학물에 의한
세포변형은 참으로 불안정하다

-------- 그밖의 줏어 들은말 -------
** 하나님을 밎지 않기때문에 벌을 받은것이다
** 알라신을 밎지 않기때문에 벌을 받은것이다
** 부처님을 밎지 않기때문에 벌을 받은것이다
** 삼신 할머니가 분노했다
** 동성애자들이 퍼트린것이다
** 환경을 오염시킨 인간에 대한 지구의 반격이다
** 스스로 정화시키기 위한 고통스러운 형벌이다
** 인류의 종말이 가까워진것이다
** 히피들이 퍼트린것이다
** 사창가 가기가 무섭다 많은 사창가가 이것때문에 직업을 바꾸었다

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